Пространственная структура генов фотосинтетической системы хлоропластов водорослей с точки зрения биоинформатики

Сенашова Мария Юрьевна

Институт вычислительного моделирования СО РАН

Рассмотрена пространственная структура генов фотосистем I и II хлоропластов водорослей. Под пространственной структурой понимается распределение точек, соответствующих частотным словарям генов, в пространстве частот триплетов. Гены фотосистем образуют два основных кластера, соответствующих прямому и обратному стренду. Не обнаружено группирования точек внутри основных кластеров ни по видам организмов, ни по типам генов, как это характерно для хлоропластов наземных растений и цианобактерий. Распределение по значениям GC-состава неоднородно. Часть надтипов имеют градиентное распределение, часть не обнаруживают выраженного порядка распределения.

порядок, кластеризация распределения, эволюция, триплеты

Вернуться назад